泛癌症启动子区DNA甲基化组的深度整合分析

定　　价：99 元

丛书名：清华大学优秀博士学位论文丛书

• 作者：刘阳
• 出版时间：2025/3/1
• ISBN：9787302679622
• 出 版 社：清华大学出版社

• 中图法分类：R730.231 
• 页码：248
• 版次：1

内容简介

"本书利用TCGA数据库提供的21种癌症的多组学数据，系统性地解析了泛癌症背景下肿瘤间DNA甲基化组的异质性，提出了一系列新的发现。
首先，DNA甲基化组的泛癌症聚类揭示了不同类型肿瘤的聚合以及新的癌症亚型，后者通常与预后差异有关。其次，在每种癌症类型中，转录因子基因的启动子区DNA甲基化谱往往比其他基因拥有更大的动态范围，这可能是癌症中转录组异质性的潜在来源。最后，本书的分析显示有大量的CpG位点与基因表达呈正相关，这种非典型启动子区CpG位点的数目是出乎意料的。这些CpG位点在CpG岛、ChIP-seq、DNaseI-seq和组蛋白修饰图谱中的分布显示，它们的存在不是由于先前所广为人知的“mCpG依赖的转录因子结合与激活”的假设。本书适合进行相关研究的师生阅读。
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