本书对南京地区抗战遗址的调查研究，具有的很强大众性与普及价值。首先，遗址不同于寻常的文字叙述，它具备实物的可接触性和场景的可视性。通过对遗址的梳理与相关史实的呈现，能够发挥对读者亲临其地的指引作用，从空间的角度连接历史与当下，加深人们对抗战历史的体会与理解；同时，抗日战争的历史不仅是一段书写民族苦难的屈辱史，更是中华民族与中国人民奋勇抵抗侵略的抗争史，南京地区的抗战遗址正是这两种历史交错的最典型见证。本书运用平实的语言对遗址进行系统梳理，引导读者穿过文字的帷幕，深化爱国主义教育，体认伟大抗战精神。
本书内容具有重要的学术价值与研究意义。南京大学中华民国史研究中心从事南京地区近代历史研究由来已久，积累了丰硕的学术成果与项目经验。对南京抗战遗址的调查编研，是南京地区学者关照所在城市历史的成果，也是近代史研究人文与地理关怀的重要体现。本书收集与利用多国史料，配以大量历史图片，力图在实证基础上把握抗战背景下南京地区社会各方面的实际状态。编者赴实地拍摄现照，观察战争遗址的保护和当下的风貌。同时，本书首次尝试完成日军在南京暴行的历史地理信息（HGIS）地图，通过将传统历史学方法与地理学空间相结合，辅助运用现代数字化技术手段，形成时间地点人物事件经纬图，不仅仅局限于对抗战暴行的简单记录，而是将视角延伸至社会心理、历史记忆等多个层面，展现立体具象的南京图景。
本书内容所传递的价值与中华优秀传统文化密切相关，是中华民族共同价值观的当代延伸。仁、义、礼、智、信作为中华民族的核心价值理念，书中所提到受难同胞的守望相助、抗日爱国义士的不屈斗争等具体案例，在战争遗址的文字介绍中生动呈现；读者不难从中了解南京饱含苦难的过去，更能理解中华民族追求和平与博爱的真义。不同以往关于南京大屠杀的普及读物，本书的旨趣并不仅限于揭批日军犯下的战争暴行，而更多关注抗战中南京民众的日常生活与心理状态，通过讲好南京遗址故事，揭示中华民族在苦难时期不畏强暴、勇于抗争、众志成城、攻坚克难的面貌。
第一章政治军事 /
第一节日军军事机关 /
一、日军驻宁军事机关 /
日军中国派遣军总司令部 /
日军中国派遣军测量队 /
日军中国派遣军野战铁道厂 /
日军华中派遣宪兵队司令部 /
日军上海派遣军司令部 /
日军南京警备司令部/日军南京防卫司令部 /
日军第十军司令部 /
日军第十六师团司令部 /
日军第九师团司令部 /
日军高射炮第二十一联队 /
日军第一六一师团独立步兵第四八〇大队 /
日军南京陆军兵事部 /
二、日军情报、宣传机关 /
梅机关 /
南京放送局/南京广播电台 /
日军报道部、报业联络室 /
三、日军运输、仓储、后勤、娱乐机关 /
大校场机场 /
日军养马场 /
明故宫机场 /
中兴贮炭场 /
宫里贮炭场 /
日军海军军需部江岸仓库 /
日军华中野战汽车厂 /
日军华中野战兵器厂/日军中国派遣军野战造兵厂 /
日军华中野战货物厂 /
南京港日军第二碇泊场司令部 /
日军独立汽车第二三四中队 /
日军第一海军军需部南京配给所 /
日军第一海军设施部南京工事事务所 /
日军第五〇兵站警备队 /
日军南京警备队安宅兵舍 /
日军铁道第十三联队 /
南京日本高级将校俱乐部 /
人民慰安所 /
东云慰安所 /
华月楼慰安所 /
安乐酒店慰安所 /
吾妻楼慰安所 /
青南楼慰安所 /
松下富贵楼慰安所 /
故乡楼慰安所 /
傅厚岗慰安所 /
鼓楼饭店中部慰安所 /
四、战俘营 /
老虎桥战俘营 /
浦口战俘营 /
五、军事训练机关 /
日军中国派遣军步兵教育队 /
日军中国派遣军总司令部特务教育队/江宁部队 /
日军中国派遣军炮兵教育队 /
日军华中下士官候补者队/日军中国派遣军南京下士官候补者队 /
日军华中经理部下士官候补者/成贤部队 /
日军华中教化队 /
日军海军射击场 /
第二节汪伪军政部门 /
一、政治部门 /
伪维新政府 /
伪南京市自治委员会 /
伪督办南京市政公署 /
伪南京特别市政府 /
二、军事部门 /
伪参谋本部 /
伪军事参议院 /
伪参赞武官公署 /
伪参军处 /
伪军政部 /
伪陆军部 /
伪海军部 /
伪军事训练部 /
伪航空署 /
伪首都宪兵司令部 /
伪南京要港司令部 /
三、军事训练机构 /
伪陆军编练总监公署 /
伪政治训练部 /
伪立法院军事专门委员会 /
伪中央陆军军士教导团 /
伪中央陆军军官学校 /
伪中央陆军将校训练团 /
伪维新政府绥靖军官学校 /
伪陆海空军同袍社 /
四、警事部门 /
伪警政部 /
伪首都警察厅/伪首都警察总监署 /
伪首都军警联合办事处 /
伪中央警官学校 /
五、特务机构 /
汪伪全国感化院 /
汪伪特工总部南京区 /
六、后勤部门 /
伪经理总监署/伪经理总监部 /
第三节日本在宁政治、外务机关 /
伪满驻汪伪大使馆 /
兴亚院华中联络部南京派遣员事务所 /
南京日本驻华大使馆 /
日本驻南京领事馆、总领事馆 /
南京日本居留民团 /
第二章经济金融 /
第一节经济 /
一、经济统制团体 /
南京日本商工会议所 /
南京统制物资关系组合联合会 /
全国商业统制总会南京办事处 /
华中军票交换用物资配给组合南京支部 /
华中商品别奥地贩卖协议会南京支部 /
华中物动组合联合会 /
华中砖瓦组合 /
南京食品组合 /
南京清凉饮料工业组合 /
南京酿造业组合 /
二、日军扶植或控制的在宁重要企业（或企业分社） /
华中矿业株式会社南京办事处 /
华中铁道株式会社南京支社 /
磐城水泥株式会社南京办事处 /
永礼化学浦口工业所南京办事处 /
有恒面粉公司 /
东亚海运株式会社南京支社 /
恒和仓库株式会社 /
华中电气通信株式会社南京营业所 /
华中都市汽车株式会社南京营业所 /
中华轮船株式会社南京办事处 /
华中水产株式会社南京办事处 /
华中水电株式会社南京支店 /
华中振兴株式会社南京事务所 /
日清汽船株式会社南京办事处及扬子福利有限公司 /
上海内河轮船株式会社南京支店 /
中华航空株式会社南京支社 /
第二节金融业 /
一、日方银行 /
横滨正金银行南京办事处 /
台湾银行（下关派遣员事务所和南京派遣员事务所） /
汉口银行南京支店 /
上海银行南京支店 /
二、汪伪银行 /
伪中央储备银行 /
伪中国国货银行南京分行 /
伪中国银行南京分行 /
伪华兴商业银行南京分行 /
南京伪交通银行农业经济办事处 /
伪南京市银行 /
第三章文教宣传 /
第一节文化机构 /
伪大民会 /
东亚联盟中国总会 /
东亚文化研究会 /
东洋文化协会华中总局 /
伪中日文化协会 /
华中占领地区图书文献接收委员会 /
伪国立中央图书馆 /
伪国立编译馆 /
中华留日同学会 /
泽存书库 /
第二节教育机构 /
南京日本女子高等学校 /
伪国立中央大学 /
伪国立第一职业学校 /
伪国立模范女子中学 /
私立中国公学 /
私立建村农学院 /
私立南方大学 /
私立南京正始中学 /
第三节新闻机构 /
日本同盟社南京支局 /
伪中央书报发行所 /
伪《中央导报》周刊社 /
伪《中报》报社 /
伪《南京民报》报社 /
伪《南京新报》报社 /
伪《南京晚报》报社 /
伪《民国日报》报社 /
伪《时代晚报》报社 /
伪《京报》报社 /
第四节宣传机构 /
伪中国广播事业建设协会 /
伪中央广播电台 /
伪军事委员会报导室 /
第四章民政卫生 /
第一节宗教机构 /
日华佛教联盟南京总会 /
毗卢寺 /
南京佛教会/南京佛学院 /
本门法华寺 /
南京神社 /
东本愿寺同仁会小组 /
曹洞宗华中布教总盟部 /
南京第一日本基督教传道所 /
第二节祭典场所 /
志公塔 /
还都纪念塔 /
保卫东亚纪念塔 /
三藏塔 /
菊花台表忠碑 /
第三节烟馆妓窑 /
风俗场所 /
华中宏济善堂南京分堂 /
第四节丛葬地 /
江东门遇难同胞丛葬地 /
草鞋峡无主孤魂墓碑 /
东郊灵谷寺无主孤魂碑 /
下关电厂殉职工友纪念碑 /
第五节卫生防疫 /
华中同仁会防疫部南京支部（南京防疫处） /
日军华中派遣军防疫给水部 /
南京鼓楼医院（金陵大学医院） /
南京第二陆军医院（第一七二兵站医院） /
第五章城市空间 /
第一节日伪要人居所 /
冈村宁次寓所 /
汪精卫公馆 /
周佛海公馆 /
第二节城市标志性建筑或设施 /
光华门 /
南京各城门 /
日人街 /
国民大会堂 /
大东亚战争博览会 /
江苏邮政管理局 /
鼓楼广场 /
下关火车站 /
浦口火车站 /
下关轮渡码头 /
新街口广场 /
第三节战后对日处置机构场所 /
中国陆军总司令部大礼堂 /
南京审判战犯军事法庭 /
南京市日侨集中营管理所 /
栖霞日俘管理所 /
汤水地区日本徒手官兵集中营 /
第六章抗日斗争 /
第一节中共党政机关 /
新四军江南指挥部纪念馆 /
横山县抗日民主政府 /
溧高县抗日民主政府 /
竹镇市抗日民主政府 /
新四军第一支队指挥部 /
新四军六师十六旅指挥部 /
新四军第一派出所旧址 /
送驾党支部纪念馆 /
第二节烈士纪念地 /
横山烈士纪念碑 /
金牛山战斗纪念碑 /
仙坛新四军抗日烈士墓 /
群力新四军抗日烈士墓 /
石村抗日英雄纪念碑 /
云台山抗日烈士陵园 /
土桥烈士陵园 /
方山烈士公墓 /
桂子山烈士陵园 /
第三节战斗遗址 /
赤山之战纪念广场 /
羊山头战斗纪念碑 /
溧高战役遗址 /
南岗战斗遗址 /
汪伪警卫第三师起义地 /
张家岗战斗遗址 /
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