《环境微生物实验/中国海洋大学环境科学与工程国家级实验教学示范中心系列教材》共分为五个部分，第一部分为基础实验技术、第二部分为现代环境微生物实验技术、第三部分为环境中的微生物、第四部分为污染物的微生物处理技术、第五部分为设计性实验，共37个实验。基础实验技术部分注重实验内容的系统性和连贯性；现代环境微生物实验技术部分注重实验内容的先进性和可操作性，并对环境微生物常用分析检测仪器的原理及使用操作逐一介绍；环境中的微生物部分注重实验内容的开拓性，并涉及不同的环境，体现了教材的“环境”特色，尤其突出“海洋”特色；污染物的微生物处理技术部分注重内容的实用性并兼顾可操作性，使学生能够得到实际应用训练；设计性实验注重实验的实施程序。
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第一部分 基础实验技术
实验1-1 培养基的制备及灭菌
附：微生物的灭菌
实验1-2 环境样品中微生物的分离、纯化及接种技术
实验1-3 环境样品中细菌菌落总数的测定
实验1-4 细菌的染色及形态观察
附：普通光学显微镜
实验1-5 微生物细胞大小的测定
实验1-6 微生物的显微镜直接计数法
实验1-7 细菌生长曲线的测定
实验1-8 微生物的MPN计数法
附：微生物的MPN法统计表
第二部分 现代环境微生物实验技术
实验2-1 细菌总DNA的提取、PCR扩增及电泳分析 第一部分 基础实验技术
实验1-1 培养基的制备及灭菌
附：微生物的灭菌
实验1-2 环境样品中微生物的分离、纯化及接种技术
实验1-3 环境样品中细菌菌落总数的测定
实验1-4 细菌的染色及形态观察
附：普通光学显微镜
实验1-5 微生物细胞大小的测定
实验1-6 微生物的显微镜直接计数法
实验1-7 细菌生长曲线的测定
实验1-8 微生物的MPN计数法
附：微生物的MPN法统计表
第二部分 现代环境微生物实验技术
实验2-1 细菌总DNA的提取、PCR扩增及电泳分析
实验2-1-1 细菌总DNA的提取
实验2-1-2 PCR扩增
实验2-1-3 琼脂糖凝胶电泳分析
实验2-2 微生物细胞的荧光探针及其检测技术
实验2-2-1 水体中微生物总数的直接计数
附：荧光显微镜
实验2-2-2 重金属铜污染对水体中细菌的致毒效应
附：流式细胞仪
实验2-2-3 荧光原位杂交（FISH）技术检测土壤中的细菌
实验2-3 环境微生物活性检测技术
实验2-3-1 土壤微生物活性的测定
附：荧光分光光度计
实验2-4 环境微生物群落多样性分析技术
实验2-4-1 土壤微生物群落的功能多样性分析（Biolog分析法）
附：Biolog自动读数仪（Microstation）
实验2-4-2 土壤微生物群落的遗传多样性分析（DGGE分析法）
实验2-5 微生物的固定化技术
实验2-5-1 海藻酸钠包埋法固定枯草芽孢杆茵
实验2-6 环境污染物毒性的微生物检测技术
实验2-6-1 发光细菌法检测环境污染物的综合生物毒性
实验2-6-2 Ames实验检测环境污染物的遗传毒性
第三部分 环境中的微生物
实验3-1 土壤环境中的微生物
实验3-1-1 根际微生物特征分析
实验3-1-2 农田土壤中好氧自生固氮茵的测定
实验3-1-3 湿地土壤中产甲烷茵及甲烷氧化茵的测定
实验3-1-4 林地土壤中纤维素分解菌的测定
实验3-2 淡水环境中的微生物
实验3-2-1 地表水及饮用水的微生物状况分析及评价
附：大肠茵群MPN检索表
实验3-2-2 人工湖中光合细菌（紫色非硫细茵）的测定
实验3-2-3 富营养化水体中氮循环茵的特征分析
实验3-3 大气中的微生物
实验3-3-1 自然沉降法检测空气中的细菌
实验3-3-2 大气生物气溶胶微生物的组成及粒径分布
实验3-4 海洋环境中的微生物
实验3-4-1 沿岸水域及沉积物微生物污染状况调查
实验3-4-2 海水养殖海域病原茵弧茵的分布
实验3-4-3 海洋发光细菌的检测
实验3-4-4 海洋工程结构物主要腐蚀微生物的检测
实验3-4-5 海洋石油污染降解微生物的分布特征
第四部分 污染物的微生物处理技术
实验4-1 SBR活性污泥法处理生活污水
实验4-2 有机固体废弃物的堆肥处理
实验4-3 石油污染土壤的固定化微生物处理
第五部分 设计性实验
一、设计性实验的实施过程
二、实验考核和成绩评定
三、设计性实验的管理
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